经历过人人喊打,韩春雨正式“复出”?

近来,韩春雨 在预印本网站 BioRxiv 宣布了一篇关于 基因修正 的新论文:Background free tracking of single RNA in living cells using catalytically inactive CasE.

该研讨开发了一种 新型的活细胞 RNA 追寻成像东西——VN-dCasE-VC,作用和可用性更强。

该论文署名单位为 河北科技大学基因修正研讨中心 ,通讯作者为 韩春雨 ,榜首作者为 顶峰

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前情回顾

2016 年 5 月 2 日,韩春雨 (河北科技大学) 作为通讯作者在世界顶级学术期刊 Nature Biotechnology 杂志宣布了题为:DNA-guided genome editing using the Natronobacterium gregoryi Argonaute(运用 NgAgo 进行 DNA 引导的基因组修正)的研讨论文。

该研讨称 NgAgo 对真核生物(包含人)具有基因修正能力。该研讨成功很快在世界范围内爆火,韩春雨教师此前籍籍无名,简直一夜之间成为学术界网红,被赞誉为“ 在三流校园取得世界一流原创成果,打破世界基因修正技术垄断”。

该论文通讯作者为 韩春雨 ,榜首作者为 顶峰 ,浙江大学教授 沈啸 为共同通讯作者,但在后续修正版别中,沈啸从作者名单中去除了。

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2016 年 8 月,河北科技大学建立基因修正研讨中心,方案投入资金逾 2 亿元。但 NgAgo 的研讨成果引发广泛质疑,2017 年 8 月 3 日,韩春雨 撤回 该论文。2018 年 8 月 31 日,河北科技大学 取消 了韩春雨所获得的荣誉称号,停止 了韩春雨团队承担的科研项目并收回了科研经费,收回 了韩春雨团队所获校科研绩效奖励。

2019 年 4 月 4 日,预印本网站 BioRxiv 刊登了一篇来自 美国 普渡大学 研讨人员的研讨论文,标明 NgAgo 经过核酸内切酶活性介导增强大肠杆菌的同源重组。BioWorld 榜首时间解读并报道了该论文,该研讨标明 NgAgo 可以修正原核生物,但不能修正真核生物基因组。

韩春雨最新论文的解读

CasE是Ⅰ- E 型 CRISPR 复合物的核心成分,它经过结合特定的茎环区域独自处理 pre-crRNA,称之为 CasE Binding S,简称为 CBSCasE 保守 His20 参加催化活性,ΔHis26-TtCse3 突变 CasE(dCasE)则失去了催化活性,但仍然与其靶标紧密结合。

在该研讨中,经过将 split 荧光与 dCasE 的 N 端和 C - 结尾(ΔHis20)交融,构建了活体 RNA 盯梢东西 VN-dCasE-VC。该体系 仅在存在靶 RNA 时才发出荧光,从而增强信噪比。

在活细胞中进行 可视化的 RNA 追寻,不需要特定的亚细胞散布。CasE-GFP 和 dCasE-GFP 在 HEK293T 细胞中的高水平表达和均匀散布标明 CasE 和 dCasE 适合于活细胞中的 RNA 操作。

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为了测验 CasE 在哺乳动物细胞中表达时是否具有强活性,作者构建了“关闭”报告基因质粒 CBS-GFP-N1。它由 5 ′-UTR 中的 GFP mRNA 和 CasE 结合位点(CBS)组成。当 CasE 被引入体系时,GFP 表达水平急剧下降。

为了进一步测验 CasE 活性,作者还构建了“敞开”报告基因质粒 RED-16×CBS-Lin28-C1,其间 CBS 插入 RED 单体基因的 3 ′-UTR 区和 Lin28 的上游。Lin28 是 RNA 核保留信号,在其 3 ′-UTR 中具有 lin28 信号的 RED 单体 mRNA 简直不能翻译成蛋白质。

CBS-CasE 依赖限制性堵截 lin28 信号并从核释放靶 mRNA 用于翻译(图 1E 和图 1F)。这些标明CasE 可以结兼并切割哺乳动物细胞中的 CBS

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为了将 dCasE-CBS 相互作用设计到 RNA 追寻体系中,作者经过将 split-FP5- 7 与 dCasE 蛋白结合。发现一个版别,即 VN-dCasE-VC 很难发出荧光,这可能是因为不正确的折叠或不稳定的状态,可是当与靶 RNA(CBS)结合时,可以 在荧光显微镜下清楚地捕获荧光信号,即便 VN-dCasE-VC 表达质粒的转染剂量十分低。

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这个示意图像的,真是一言难尽 …

接下来作者运用 VN-dCasE-VC 体系追寻哺乳动物细胞中过表达的 β - 肌动蛋白 (β-Actin) 的 mRNA,VN-dCasE-VC 体系在细胞质中显示出强荧光。此外还观察到,向靶 mRNA 添加更多 CBS 可改进信号,荧光追寻更明晰,因而,可以经过增加 CBS 的数量来检测低丰度的 mRNA。

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总的来说,韩春雨 团队发明了一种 新的 RNA 追寻东西,将其命名为VN-dCasE-VC。该体系可以追寻活细胞中没有背景的特定 RNA,经过荧光将其可视化。

现在已有两种活细胞 RNA 追寻成像东西,一种是 MS2,一种是 Cas13a,韩春雨团队开发的 dCasE 体系,成像作用因为 MS2,而且,dCasE 蛋白的分子量为 22kDa,远小于 Cas13a 的 130kDa,dCasE 的小分子量更简单递送至细胞内,因而更适合用于活细胞的 RNA 追寻

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通讯作者:韩春雨

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榜首作者:顶峰

正文完
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