1952 年曹楚南毕业于同济大学化学系，分配至我国科学院；1982 年任研究员；1985 年兼任我国科学院金属腐蚀与防护研究所学术委员会副主任；1987 年调入我国科学院金属腐蚀与防护研究所，同年任该所学位委员会主任；1990 年担任我国科学院材料科学技术委员会委员、博士生导师；1991 年当选为我国科学院学部委员；1994 年调入浙江大学任化学系教授；1998 年当选为我国科学院技术科学部常委；1999 年兼任浙江大学环境与资源学院院长。
曹楚南领导和开拓了我国腐蚀电化学领域的开展。
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